* using log directory 'd:/Rcompile/CRANpkg/local/4.7/sjSDM.Rcheck' * using R Under development (unstable) (2026-05-19 r90065 ucrt) * using platform: x86_64-w64-mingw32 * R was compiled by gcc.exe (GCC) 14.3.0 GNU Fortran (GCC) 14.3.0 * running under: Windows Server 2022 x64 (build 20348) * using session charset: UTF-8 * current time: 2026-05-22 20:04:01 UTC * checking for file 'sjSDM/DESCRIPTION' ... OK * checking extension type ... Package * this is package 'sjSDM' version '1.0.7' * package encoding: UTF-8 * checking package namespace information ... OK * checking package dependencies ... OK * checking if this is a source package ... OK * checking if there is a namespace ... OK * checking for hidden files and directories ... OK * checking for portable file names ... OK * checking whether package 'sjSDM' can be installed ... OK * checking installed package size ... OK * checking package directory ... OK * checking 'build' directory ... OK * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * checking top-level files ... OK * checking for left-over files ... OK * checking index information ... OK * checking package subdirectories ... OK * checking code files for non-ASCII characters ... OK * checking R files for syntax errors ... OK * checking whether the package can be loaded ... [64s] ERROR ── Attaching sjSDM ──────────────────────────────────────────────────── 1.0.7 ── Error in Sys.setenv(PATH = new_path) : 'names' and 'val' are of different lengths In addition: Warning messages: 1: In system(cmd, intern = intern, wait = wait | intern, show.output.on.console = wait, : running command 'C:\Windows\system32\cmd.exe /c D:\temp\2026_05_22_01_50_00_13666\RtmpEHYIu1\file23f434f81392c.bat' had status 1033 2: In system(cmd, intern = intern, wait = wait | intern, show.output.on.console = wait, : running command 'C:\Windows\system32\cmd.exe /c D:\temp\2026_05_22_01_50_00_13666\RtmpEHYIu1\file23f4344527db3.bat' had status 1033 Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. ✖ torch ✔ torch_optimizer ✔ pyro ✔ madgrad Torch or other dependencies not found: 1. Use install_sjSDM() to install Pytorch and conda automatically 2. Installation trouble shooting guide: ?installation_help 3. If 1) and 2) did not help, please create an issue on (see ?install_diagnostic) It looks like this package has a loading problem: see the messages for details. * checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... [74s] WARNING ── Attaching sjSDM ──────────────────────────────────────────────────── 1.0.7 ── Error in Sys.setenv(PATH = new_path) : 'names' and 'val' are of different lengths In addition: Warning messages: 1: In system(cmd, intern = intern, wait = wait | intern, show.output.on.console = wait, : running command 'C:\Windows\system32\cmd.exe /c D:\temp\2026_05_22_01_50_00_13666\Rtmpg1EAhz\file21bd9453691bf9.bat' had status 1033 2: In system(cmd, intern = intern, wait = wait | intern, show.output.on.console = wait, : running command 'C:\Windows\system32\cmd.exe /c D:\temp\2026_05_22_01_50_00_13666\Rtmpg1EAhz\file21bd9465305845.bat' had status 1033 Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. ✖ torch ✔ torch_optimizer ✔ pyro ✔ madgrad Torch or other dependencies not found: 1. Use install_sjSDM() to install Pytorch and conda automatically 2. Installation trouble shooting guide: ?installation_help 3. If 1) and 2) did not help, please create an issue on (see ?install_diagnostic) It looks like this package (or one of its dependent packages) has an unstated dependence on a standard package. All dependencies must be declared in DESCRIPTION. See section 'The DESCRIPTION file' in the 'Writing R Extensions' manual. * checking whether the package can be unloaded cleanly ... [62s] WARNING ---- unloading * checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... [83s] WARNING Warning in system(cmd, intern = intern, wait = wait | intern, show.output.on.console = wait, : running command 'C:\Windows\system32\cmd.exe /c D:\temp\2026_05_22_01_50_00_13666\Rtmpodd4Bp\file1978242a7b781d.bat' had status 1033 Warning in system(cmd, intern = intern, wait = wait | intern, show.output.on.console = wait, : running command 'C:\Windows\system32\cmd.exe /c D:\temp\2026_05_22_01_50_00_13666\Rtmpodd4Bp\file1978241f356765.bat' had status 1033 Error in Sys.setenv(PATH = new_path) : 'names' and 'val' are of different lengths Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. A namespace must be able to be loaded with just the base namespace loaded: otherwise if the namespace gets loaded by a saved object, the session will be unable to start. Probably some imports need to be declared in the NAMESPACE file. * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... [39s] WARNING ---- unloading * checking loading without being on the library search path ... [35s] WARNING ── Attaching sjSDM ──────────────────────────────────────────────────── 1.0.7 ── Error in Sys.setenv(PATH = new_path) : 'names' and 'val' are of different lengths In addition: Warning messages: 1: In system(cmd, intern = intern, wait = wait | intern, show.output.on.console = wait, : running command 'C:\Windows\system32\cmd.exe /c D:\temp\2026_05_22_01_50_00_13666\RtmpQdi0bB\file1168d419f157e.bat' had status 1033 2: In system(cmd, intern = intern, wait = wait | intern, show.output.on.console = wait, : running command 'C:\Windows\system32\cmd.exe /c D:\temp\2026_05_22_01_50_00_13666\RtmpQdi0bB\file1168d4ec83126.bat' had status 1033 Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. ✖ torch ✔ torch_optimizer ✔ pyro ✔ madgrad Torch or other dependencies not found: 1. Use install_sjSDM() to install Pytorch and conda automatically 2. Installation trouble shooting guide: ?installation_help 3. If 1) and 2) did not help, please create an issue on (see ?install_diagnostic) It looks like this package has a loading problem when not on .libPaths: see the messages for details. * checking whether startup messages can be suppressed ... [46s] NOTE Error in Sys.setenv(PATH = new_path) : 'names' and 'val' are of different lengths Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. It looks like this package (or a package it requires) has a startup message which cannot be suppressed: see ?packageStartupMessage. * checking use of S3 registration ... OK * checking dependencies in R code ... NOTE Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. * checking S3 generic/method consistency ... WARNING Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. See section 'Generic functions and methods' in the 'Writing R Extensions' manual. * checking replacement functions ... WARNING Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. The argument of a replacement function which corresponds to the right hand side must be named 'value'. * checking foreign function calls ... NOTE Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. See chapter 'System and foreign language interfaces' in the 'Writing R Extensions' manual. * checking R code for possible problems ... [81s] NOTE Error in Sys.setenv(PATH = new_path) : 'names' and 'val' are of different lengths Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. * checking Rd files ... [1s] OK * checking Rd metadata ... OK * checking Rd cross-references ... OK * checking for missing documentation entries ... WARNING Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. All user-level objects in a package should have documentation entries. See chapter 'Writing R documentation files' in the 'Writing R Extensions' manual. * checking for code/documentation mismatches ... WARNING Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. * checking Rd \usage sections ... NOTE Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. Der Befehl "DOSKEY" ist entweder falsch geschrieben oder konnte nicht gefunden werden. The \usage entries for S3 methods should use the \method markup and not their full name. See chapter 'Writing R documentation files' in the 'Writing R Extensions' manual. * checking Rd contents ... OK * checking for unstated dependencies in examples ... OK * checking contents of 'data' directory ... OK * checking data for non-ASCII characters ... [0s] OK * checking LazyData ... OK * checking data for ASCII and uncompressed saves ... OK * checking installed files from 'inst/doc' ... OK * checking files in 'vignettes' ... OK * checking examples ... [37s] OK * checking for unstated dependencies in 'tests' ... OK * checking tests ... [45s] OK Running 'testthat.R' [44s] * checking for unstated dependencies in vignettes ... OK * checking package vignettes ... OK * checking re-building of vignette outputs ... [2s] OK * checking PDF version of manual ... [22s] OK * checking HTML version of manual ... [14s] OK * DONE Status: 1 ERROR, 9 WARNINGs, 5 NOTEs